Pirms aiziešanas, 1977.gadā, Šrīla Prabhupāda izveidoja Pārvaldības komisiju (GBC) kā ISKCON galveno vadošo pārvadības mehānismu. Tās galvenais pienākums ir saglabāt, izplatīt un izpildīt Šrīlas Prabhupādas norādījumus. GBC tiekas Mājāpurā, Rietumbengālijā, uz ikgadējo kopsapulci un pieņem lēmumus balsošanas procesā. Komisiju veido trīsdesmit locekļi, kuri individuāli pārrauga un seko, lai tiktu ievēroti garīgie standarti visos ISKCON centros, saistītajos projektos, starp bhaktām noteiktajos ģeogrāfiskajos reģionos. GBC dalībnieki arī pārrauga projektus, iniciatīvas un kalpošanu. Izpilddirektors, ISKCON ministriju vadītāji un GBC deputāti atbalsta GBC. GBC pakļautībā strādā reģionālās pārvaldes institūcijas (RGB) un tempļu prezidenti. Katrs ISKCON templis ir individuāli reģistrēts un pārvalda savas lietas ar vietējās vadības starpniecību.